ELY-keskuksella on luonnonsuojelulakiin perustuva velvoite toteuttaa luonnonsuojelua osalla Natura 2000 -verkoston kohteita sekä valtakunnallisten suojeluohjelmien (suot, lintuvedet, lehdot, rannat, vanhat metsät, kansallis- ja luonnonpuistojen kehittäminen) alueilla turvaten niille tyypillisten luontotyyppien ja lajien säilymistä.
Krokskärin saariryhmä
Korppoon eteläisessä saaristossa suojeltiin yhteistyössä maanomistajan kanssa noin 240 hehtaarin suuruinen Krokskärin saariryhmä merialueineen. Saaristomeren kansallispuistoon rajautuva saariryhmä kuuluu Natura 2000 -verkostoon. Sen luodot ja karikot muodostavat otollisen elinympäristön linnustolle.
Saaristomeren suurin yksityinen luonnonsuojelualue
Gullkronan saarta ympäröiville vesialueille perustettiin Saaristomeren suurin yksityinen merensuojelualue, noin 4 800 hehtaaria. Keskeisessä roolissa suojelun toteutumisessa olivat maanomistaja eli Paraisten Gullkronan kalastuskunta sekä laajapohjaista yhteistyöryhmää vetänyt Baltic Sea Action Group ja Metsähallitus. Rauhoitusmääräyksillä turvataan vedenalaista luontoa ja lintujen pesimärauhaa sekä edistetään EU:n biodiversiteettistrategian tavoitteita merialueiden suojelun osalta.
Arvokkaat metsät
Merkittävä rooli uusien suojelualueiden perustamisessa oli myös Etelä-Suomen metsien monimuotoisuuden toimintaohjelmalla (Metso) sekä Helmi-ympäristöohjelmalla. Varsinais-Suomen ely-keskuksen alueella suojeltiin Metso-rahoituksella noin tuhat hehtaaria arvokkaita metsiä. Helmi-ohjelmassa puolestaan suojeltiin noin 2 000 hehtaaria arvokkaita soita. Lounais-Suomessa on tällä hetkellä suojelun piirissä lähes 125 700 hehtaarin verran alueita.
Luonnonsuojelun merkitys
Suojelun piirissä on tällä hetkellä lähes 125 700 hehtaarin verran alueita Satakunnassa ja Varsinais-Suomessa. Suojelualueverkoston tarkoituksena on omalta osaltaan edistää ja säilyttää luonnon monimuotoisuutta sekä suojelualueiden kytkeytyneisyyttä, ehkäistä luontokatoa ja parantaa lajien ja luontotyyppien mahdollisuuksia sopeutua ilmastonmuutokseen. Säilyttämällä hiilinieluja ja -varastoja (metsät, suot, meri) hillitään myös ilmastonmuutosta.